Коронавирус совершил ускоренную эволюцию в организме пациентки со сниженным иммунитетом, накопив 18 мутаций за почти полгода болезни. Об этом в своем отчете на Virological пишут российские медики.
Отмечается, что 47-летняя женщина с В-клеточной лимфомой, которая проходила курс химиотерапии в конце марта и начале апреля 2020 года, заразилась коронавирусом от пожилой женщины, с которой была в одной палате.
Расшифровка генома из августовского мазка больной С. и сравнение его с генетической последовательностью из весеннего мазка показала наличие 18 новых мутаций, две из которых (Y453F и Δ69-70HV) затрагивали S-белок: тот самый, который образует шипы на поверхности вирусных частиц.
Ученые отмечают, что этот белок отвечает за "абордаж" клеток-жертв, и изменения в нем весьма важны, так как могут влиять на силу связывания вирусных частиц с клеткой, а антител – с этой частью вируса. То есть, мутации в S-белке потенциально могут сделать вакцины неэффективными: их придется оперативно корректировать под ускользающие от иммунного ответа штаммы.
Комбинация мутаций Y453F и Δ69-70HV известна как "норковая": ее впервые обнаружили у этих животных в Дании. Но штамм пациентки С. никоим образом не был связан генеалогически с норковым: он развился самостоятельно.
Авторы подчеркивают: ранее мутацию Δ69-70HV уже находили у штамма другого пациента с ослабленным иммунитетом, которого лечили плазмой с антителами от переболевших ковидом.
Другие ученые высказывали предположение, что более заразный "британский" штамм B.1.1.7 появился также у пациента с хронической инфекцией: у таких пациентов якобы происходит ускоренная эволюция патогена. То есть, их иммунитет не может эффективно и быстро уничтожить инфекцию: в результате вирус успевает мутировать и некоторые полезные для него изменения (например, в части ускользания от антител) закрепляются. Это, однако, не доказано, и остается только одной из теорий.
Авторы предостерегают: штаммы, которые появились у пациентов с ослабленным иммунитетом (или у норок), "могут позже распространиться в популяции и влиять на характеристики циркулирующих там штаммов".